Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms