Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms