Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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