Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms