Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms