Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab5cP35278 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab5cP35278 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms