Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms