Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ggta1P23336 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ggta1P23336 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ggta1P23336 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ggta1P23336 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ggta1P23336 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms