Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms