Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pax1P09084 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax1P09084 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms