Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms