Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TtrP07309 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TtrP07309 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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