Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myl1P05977 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myl1P05977 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms