Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ccl20O89093 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Ccl20O89093 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Ccl20O89093 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ccl20O89093 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ccl20O89093 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ccl20O89093 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ccl20O89093 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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