Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

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Length 1,021 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pdzd7E9Q9W7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pdzd7E9Q9W7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pdzd7E9Q9W7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pdzd7E9Q9W7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pdzd7E9Q9W7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pdzd7E9Q9W7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pdzd7E9Q9W7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pdzd7E9Q9W7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd7E9Q9W7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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