Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms