Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms