Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn8B1ARD8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms