Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms