Protein–RNA interactions for Protein: S4R2P9

Slc8a3, Sodium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a3S4R2P9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc8a3S4R2P9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc8a3S4R2P9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc8a3S4R2P9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc8a3S4R2P9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms