Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Thbs4Q9Z1T2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thbs4Q9Z1T2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms