Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d3Q9Z1L5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms