Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp2Q9Z0E6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gbp2Q9Z0E6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp2Q9Z0E6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms