Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1gQ9WU39 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1gQ9WU39 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1gQ9WU39 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1gQ9WU39 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1gQ9WU39 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scnn1gQ9WU39 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms