Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpv2Q9WTR1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv2Q9WTR1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv2Q9WTR1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms