Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTL2

Rab25, Ras-related protein Rab-25, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab25Q9WTL2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab25Q9WTL2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rab25Q9WTL2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab25Q9WTL2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 353.7 ms