Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TfebQ9R210 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TfebQ9R210 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TfebQ9R210 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TfebQ9R210 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TfebQ9R210 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TfebQ9R210 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TfebQ9R210 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TfebQ9R210 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TfebQ9R210 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TfebQ9R210 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TfebQ9R210 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TfebQ9R210 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TfebQ9R210 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TfebQ9R210 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TfebQ9R210 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TfebQ9R210 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TfebQ9R210 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms