Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrpxQ9R0M3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrpxQ9R0M3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms