Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek3Q9R0A5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek3Q9R0A5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek3Q9R0A5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms