Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CtsfQ9R013 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms