Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp11cQ9QZW0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp11cQ9QZW0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms