Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChmlQ9QZD5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmlQ9QZD5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChmlQ9QZD5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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