Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps29Q9QZ88 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps29Q9QZ88 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vps29Q9QZ88 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms