Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

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Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vnn3Q9QZ25 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vnn3Q9QZ25 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms