Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tomm40Q9QYA2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tomm40Q9QYA2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms