Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd1Q9QY80 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd1Q9QY80 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hacd1Q9QY80 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms