Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnip3Q9QXT8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnip3Q9QXT8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip3Q9QXT8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms