Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ChmQ9QXG2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ChmQ9QXG2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChmQ9QXG2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChmQ9QXG2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms