Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Homer2Q9QWW1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Homer2Q9QWW1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Homer2Q9QWW1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms