Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc4Q9QUQ5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc4Q9QUQ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc4Q9QUQ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms