Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmub1Q9JMG3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmub1Q9JMG3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmub1Q9JMG3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmub1Q9JMG3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmub1Q9JMG3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmub1Q9JMG3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmub1Q9JMG3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmub1Q9JMG3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms