Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SrfQ9JM73 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrfQ9JM73 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrfQ9JM73 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrfQ9JM73 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrfQ9JM73 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrfQ9JM73 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrfQ9JM73 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrfQ9JM73 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms