Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK3

Cabp5, Calcium-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp5Q9JLK3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cabp5Q9JLK3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cabp5Q9JLK3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp5Q9JLK3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp5Q9JLK3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp5Q9JLK3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp5Q9JLK3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp5Q9JLK3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cabp5Q9JLK3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cabp5Q9JLK3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cabp5Q9JLK3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cabp5Q9JLK3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp5Q9JLK3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cabp5Q9JLK3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.5 ms