Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr5Q9JLF7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlr5Q9JLF7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms