Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Habp4Q9JKS5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Habp4Q9JKS5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Habp4Q9JKS5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms