Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf3Q9JKL4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms