Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4m1Q9JKC7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ap4m1Q9JKC7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap4m1Q9JKC7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms