Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Efcc1Q9JJF6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Efcc1Q9JJF6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms