Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sv2aQ9JIS5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sv2aQ9JIS5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2aQ9JIS5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.1 ms