Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup50Q9JIH2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup50Q9JIH2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms